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外显子捕获测序/目标区域捕获测序

外显子捕获测序,是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域或目标区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的分析方法。在人类基因中大约有180,000外显子,占人类基因组的1%,约30MB。外显子测序相对于基因组重测序成本较低,对研究已知基因的SNPIndel等具有较大的优势。

产品列表

外显子捕获测序

目标区域捕获测序

捕获平台

Agilent SureSelect捕获/Nimblegen液相捕获 SeqCap EZ Choice Library

Agilent Sureselect XT Custom Kit

测序策略

HiSeq PE125

HiSeq PE125

测序深度

50X

200X(平均有效测序深度)

样品要求

样品量:细胞样品请提供至少 2×107个细胞,组织样品请提供至少 100mg的组织块或切片,DNA样品请提供 10 μg以上的 DNA

样品质量:基因组 DNA无明显降解,主带清晰,大于 23Kb,无明显弥散。 OD260/280值在1.8~2.0之间,浓度 ≥500 ng/μl

数据分析

SNPInDelSVCNV检测、注释及统计

Somatic SNVInDelSVCNV检测、注释及统计(肿瘤成对样本)

项目周期

70工作日

100工作日