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CircRNA 测序服务

环状RNAcircularRNA circRNA )是一类特殊的非编码RNA分子,是近年来RNA领域研究的最新特点。与传统的线性RNA不同,circRNA分子呈封闭环状结构,不受外切酶影响,表达更稳定,不容易降解。在功能上,circRNA在细胞中起miRNA海绵吸附作用,解除了miRNA对靶基因的抑制作用,提升了靶基因的表达水平。通过与疾病关联的miRNA相互作用,在疾病中发挥着重要的作用。

实验流程

产品列表

 

circRNA测序

        文库类型

链特异性测序

测序策略

PE125

数据量要求

10G20G

线性 RNA 去除

RNase R 去除线性 RNA

rRNA去除

需要

 

样品要求

样品量:细胞大于1×107个细胞,组织样品大于300mg的组织块或切片,RNA样品大于20 μg的总RNA
样品质量:RNA无明显降解,总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl28S:18S 1.5RIN 8

 

数据分析

circRNA 鉴定、circRNA 来源基因分析、circRNA 表达水平分析
差异表达分析、GO富集分析、circRNA 可变剪切分析
circRNA 
注释、circRNA 序列分析、miRNA 结合位点预测

项目周期

70工作日

 

数据分析流程图