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LncRNA测序服务

长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNAlncRNA测序是利用高通量测序技术对已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有lncRNAmRNA进行测序。

实验流程

产品列表

LncRNA测序

文库类型

链特异性文库

测序策略

HiseqPE125

数据量

10G以上

rRNA去除

需要

样品

样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。
样品量:细胞大于1×107个细胞,组织样品大于300mg的组织块或切片,RNA样品大于10 μg的总RNA
样品质量:RNA无明显降解,总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl28S:18S 1.5RIN 8

数据分析

lncRNA 拼接组装、lncRNA 点筛选、ncRNA 靶基因预测
基因组表达分布检查、lncRNA 保守性分析、mRNA可变剪切分析
mRNA
差异基因富集分析、 mRNASNP/InDel 分析
lncRNA
mRNA差异表达分析、lncRNA-mRNA 共表达网络构建

周期

60工作日

数据分析流程