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原核生物转录组测序


由于原核生物mRNA没有polyA 尾结构,需要去除rRNA的特点,对不同的研究物种采取去除rRNA,利用第二代高通量测序技术对原核生物的转录本(mRNA和非编码RNA)进行测序,全面快速地获取特定微生物在特定状态下的所有转录本的信息。

实验流程

产品列表

原核生物转录组测序

文库类型

链特异性文库

测序策略

HiseqPE125

数据量

1G2G

rRNA去除

需要

样品

样品类型:菌体或RNA样品。
样品量:RNA 总量≥20.0μg

样品质量:浓度≥65ng/μlOD260/2801.823S/16S1RIN6.0

数据分析

测序整体质量评估、基因表达水平分析、差异基因分析
差异基因 GO 富集、差异基因 KEGG 富集、UTR 分析
新转录本预测、反义转录本预测、SNP InDel 分析

周期

45工作日

数据分析流程